Антигены ГКГ, согласно современным представлениям, также могут принимать участие в формировании толерантности. В этом плане привлекают внимание антигены I класса ГКГ локуса G, который представлен неклассическими молекулами, имеющими ограниченный полиморфизм. Первое сообщение о возможности HLA-G вызывать развитие толерантности появилось сравнительно недавно при исследовании клеток меланомы, которые ингибировали цитотоксичность EK и таким образом способствовали уходу опухоли из-под иммунологического контроля, — данные были получены при исследовании как клеток различных линий, так и биопсийного материала. Указанные результаты подтверждены и работами других авторов, которые при исследовании клеток меланомы также показали, что если эти клетки экспрессируют HLA-G, то они способны вызывать развитие толерантности. Механизм этой толерантности авторы объясняют экспрессией рецепторов, ингибирующих цитотоксичность как СВ8+-лимфоцитов, так и EK.

Наряду с указанной возможностью индукции толерантности есть основания предполагать, что в некоторых случаях ее развитию может способствовать также экспрессия классических молекул антигенов ГКГ. Такое предположение сделано на основании упоминавшегося факта, согласно которому в ряде случаев при некоторых предраковых заболеваниях, например кожи, а иногда и при уже развившихся опухолях усиливается экспрессия антигенов II класса ГКГ, в частности HLA-DR кератиноцитами. В результате формируется толерантность, которая рассматривается как Т-зависимая.

Иллюстрацией того, что экспрессия определенных антигенов комплекса гистосовместимости может иметь отрицательные последствия служат и чрезвычайно интересные данные об использовании различных клонов фибросаркомы мышей. Эти клетки были получены из метастазов в лимфатических узлах с последующим анализом экспрессии антигенов Н2 I и II классов. Установлено, что экспрессия молекул H2-Kd и H2-Dd I класса очень выражена в большинстве клеток метастазов; в отличие от этого экспрессия молекул Ld либо отсутствовала, либо была слабо выражена. Что касается экспрессии антигенов II класса, то она не наблюдалась на всех изученных клетках. Особое внимание исследователи обращают на то, что увеличение экспрессии H2-Kd и H2-Dd ассоциировалось с резистентностью к действию EK. В результате этих работ был сделан в высшей степени важный вывод: селективное снижение экспрессии молекул Ld и усиление Kd и Dd I класса может иметь существенное значение для ускользания опухоли из-под иммунологического контроля.