При изложении данных о роли ДК в распознавании указывалось, что эти клетки способны индуцировать не только специфический иммунологический ответ, но и специфическую толерантность. Как известно, некоторые ДК экспрессируют СD8-антиген, соответственно выделяют два клона ДК — CD8α-отрицательные и СD8α-положительные; последние характеризуются как толерогенные, т. е. способные участвовать в индукции толерантности.

Одним из механизмов формирования иммунологической толерантности с участием ДК является элиминация последними аутореактивных Т-лимфоцитов. В частности, при появлении большого количества ДК развитие толерантности может быть обусловлено либо тем, что нагруженные опухолевыми пептидами ДК истощают клон отвечающих Т-клеток с последующей их гибелью, либо активированные ДК элиминируют аутореактивные Т-лимфоциты. Включение этого механизма, подобно тому как это имеет место и при стимуляции CD4+T-лимфоцитов, во многом зависит от соотношения зрелых и незрелых ДК: установлено, что при наличии необходимых условий зрелые ДК формируют Т-клеточный иммунитет, а незрелые — Т-клеточную толерантность. Исходя из этого общего принципа появление большого количества незрелых ДК способствует формированию толерантности, которая может быть прервана введением оптимальных концентраций зрелых ДК.

Роль ДК в индукции толерантности к опухолевым антигенам практически не исследована. Это не исключает, что такая возможность зависит от свойств опухолевых пептидов, образующих комплекс с антигенами ГКГ.